Myös vuonna 2006 nähtiin hienoja läpimurtoja alternative-listoilla. Yhden vuoden kovimmista hiteistä teki Gnarls Barkley, joka nousi pinnalle täydestä tuntemattomuudesta. Suurin osa vuoden hienoista hiteistä oli ennestään tunnettujen artistien tuotoksia, kuten Muse ja The Killers. Tulokkaitakin silti riitti. Heidän joukossaan oli muun muassa myöhemmin supersuosioon noussut The Black Keys.